Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccl8Q9Z121 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Ccl8Q9Z121 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccl8Q9Z121 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccl8Q9Z121 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccl8Q9Z121 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl8Q9Z121 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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