Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms