Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trex2Q9R1A9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms