Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nek3Q9R0A5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nek3Q9R0A5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nek3Q9R0A5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nek3Q9R0A5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nek3Q9R0A5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms