Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Gpc6Q9R087 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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