Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nphs1Q9QZS7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphs1Q9QZS7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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