Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms