Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC1

Pcnx1, Pecanex-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx1Q9QYC1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pcnx1Q9QYC1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms