Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rabgef1Q9JM13 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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