Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Upk3aQ9JKX8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upk3aQ9JKX8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms