Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scube2Q9JJS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Scube2Q9JJS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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