Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup50Q9JIH2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms