Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Riok3Q9DBU3 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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