Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clca1Q9D7Z6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Clca1Q9D7Z6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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