Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms