Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3a3Q9D554 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3a3Q9D554 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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