Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms