Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elp3Q9CZX0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms