Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms