Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rab5aQ9CQD1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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