Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrbp1Q99PL5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms