Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms