Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms