Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb6Q922F4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms