Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarca5Q91ZW3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms