Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klc3Q91W40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms