Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms