Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phc3Q8CHP6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms