Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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