Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd4lQ8CFI0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms