Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms