Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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