Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Col6a6Q8C6K9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col6a6Q8C6K9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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