Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg16l1Q8C0J2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg16l1Q8C0J2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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