Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad3Q8BUN5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad3Q8BUN5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms