Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Atg4dQ8BGV9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4dQ8BGV9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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