Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc29Q80VM3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc29Q80VM3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms