Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dsg1cQ7TSF0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms