Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ScocQ78YZ6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScocQ78YZ6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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