Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Atp8b3Q6UQ17 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp8b3Q6UQ17 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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