Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1cQ6PDZ2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Taf1cQ6PDZ2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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