Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhod1Q6P9Q4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms