Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg9aQ68FE2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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