Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema4aQ62178 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms