Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms