Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtprnQ60673 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtprnQ60673 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PtprnQ60673 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprnQ60673 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprnQ60673 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprnQ60673 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtprnQ60673 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtprnQ60673 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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