Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh2Q5SW75 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms