Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Fam208bQ5DTT3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Fam208bQ5DTT3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Fam208bQ5DTT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam208bQ5DTT3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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