Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spire1Q52KF3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms