Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2Q3V1H1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms